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illumina二代測序儀

更新時(shí)間:2022-06-12

簡(jiǎn)要描述:

illumina二代測序儀MiSeq系統可通過(guò)各種測序應用為您的研究提供便利。它能夠自動(dòng)生成雙端read,每次運行的產(chǎn)出高達15 Gb,每條read可提供600多個(gè)堿基的測序數據。它使用的文庫制備試劑盒已針對多種應用進(jìn)行了優(yōu)化,包括靶向基因測序、小型基因組測序、擴增子測序、16S宏基因組學(xué)等。

Illumina公司推出MiSeq是一臺在單個(gè)儀器上整合了擴增、測序和數據分析的新款測序儀,每次運行能產(chǎn)生超過(guò)1Gb的數據,且占地面積僅為2平方英尺。MiSeq的流程和準確性,讓它成為快速且經(jīng)濟的遺傳分析的理想平臺,適合廣泛的應用。同時(shí)Illumina已被FDA大量采購并即將通過(guò)FDA認證,12年10月,MiSeq系統的測序通量已升級至8G左右。升級通過(guò)兩個(gè)方面完成,一個(gè)是cluster密度的增大,升級后cluster密度增加至15-17million,而pair-end讀取的reads數目將會(huì )增加至30-34million;另一方面是通過(guò)測序讀長(cháng)而提升通量,測序讀長(cháng)達到2*300bp,同時(shí)測序速度也有所提升。目前,Broad研究院已經(jīng)利用現有試劑實(shí)現了單端測序300bp讀長(cháng),Illumina目前內部測序更是完成了2*400bp的pair-end測序。而這些,都是保證在高質(zhì)量數據結果的前提下完成的。


MiSeq性能參數


Illumina MiSeq測序時(shí)間和數據量


讀長(cháng)(bp)時(shí)間總數據量Q30
1×36~4 hrs540-610 Mb﹥90%
2×25~5.5 hrs750-850 Mb﹥90%
2×100~16.5 hrs3.0-3.4 Gb﹥85%
2×150~24 hrs4.5-5.1 Gb﹥80%
2×250~39 hrs7.5-8.5 Gb﹥70%



Illumina MiSeq讀取量比對


運行類(lèi)型通過(guò)過(guò)濾的讀?。ò偃f(wàn))
升級前升級后
單端讀取5-7 M15-17 M
末端配對讀取10-14 M30-34 M


工作流程


illumina二代測序儀 MiSeq四大特性

1、較短的實(shí)驗周期:從樣品制備開(kāi)始需要8小時(shí)即可得到超過(guò)100M的高質(zhì)量測序結果。

2、便捷的樣品制備流程:需50ngDNA模板,2小時(shí)的自動(dòng)化操作就可以完成全部樣品制備工作。

3、測序原理:MiSeq繼續GA和HiSeq平臺的邊合成邊測序的化學(xué)原理。

4、完整的整合功能:MiSeq可以獨立完成簇生成,雙向測序及數據分析工作,讓經(jīng)費和實(shí)驗室空間不再成為NGS研究的障礙。


illumina二代測序儀 MiSeq應用范圍

1、轉錄組測序

派森諾MiSeq測序平臺是基因組已測序物種的轉錄組分析平臺。公司技術(shù)團隊目前已完成了包括斑馬魚(yú)在內的多種植物、動(dòng)物的轉錄組測序及分析。


2、宏基因組16S rDNA單V區測序

對16s rDNA的單V區(V3\V4)進(jìn)行高通量測序,鑒定細菌群和古生菌群。派森諾的技術(shù)團隊使用Illumina MiSeq測序16S rDNA V4區并結合Roche 454 FLX+測序16S rDNA V1~V3區成功的對雞的腸道環(huán)境細菌進(jìn)行了鑒定。


3、Small RNA測序

1*35bp的讀長(cháng)配合了小RNA的測序長(cháng)度,速度快,靈敏度高。派森諾的技術(shù)團隊目前已完成了鵝的小RNA測序和多種中草藥的小RNA測序。


4、重測序:包括全基因組重測序、簡(jiǎn)化基因組測序、外顯子測序。

Illumina MiSeq非常適用于對微生物基因組的重測序,每次運行即可完成一個(gè)微生物基因組測序。2011年12月27日,派森諾的技術(shù)團隊利用MiSeq一次運行同時(shí)完成了乳酸菌(Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8)的重測序,基因組覆蓋深度為分別為404倍和213倍,比對至參考序列,基因組實(shí)現全覆蓋,同時(shí)檢測到了多種結構變異,包括插入、缺失和SNP位點(diǎn),并且檢測到了全部質(zhì)粒。


數據展示

* 以上產(chǎn)品介紹及數據來(lái)源于Illumina,僅供參考,以Illumina為準。



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